Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uchl4P58321 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl4P58321 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl4P58321 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Uchl4P58321 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl4P58321 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl4P58321 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms