Protein–RNA interactions for Protein: P56845

Tcl1b5, Protein TCL1B5, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcl1b5P56845 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcl1b5P56845 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcl1b5P56845 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms