Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp5P56399 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp5P56399 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp5P56399 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp5P56399 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp5P56399 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp5P56399 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp5P56399 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp5P56399 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp5P56399 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp5P56399 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp5P56399 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp5P56399 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp5P56399 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp5P56399 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp5P56399 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp5P56399 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp5P56399 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp5P56399 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp5P56399 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp5P56399 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp5P56399 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp5P56399 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp5P56399 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp5P56399 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp5P56399 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp5P56399 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp5P56399 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp5P56399 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp5P56399 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp5P56399 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp5P56399 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp5P56399 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp5P56399 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp5P56399 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp5P56399 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp5P56399 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp5P56399 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp5P56399 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp5P56399 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp5P56399 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp5P56399 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp5P56399 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp5P56399 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp5P56399 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp5P56399 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp5P56399 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp5P56399 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp5P56399 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp5P56399 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp5P56399 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp5P56399 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms