Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CdaP56389 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CdaP56389 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CdaP56389 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CdaP56389 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CdaP56389 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CdaP56389 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CdaP56389 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CdaP56389 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CdaP56389 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CdaP56389 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CdaP56389 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CdaP56389 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CdaP56389 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CdaP56389 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CdaP56389 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CdaP56389 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CdaP56389 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CdaP56389 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CdaP56389 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CdaP56389 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CdaP56389 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CdaP56389 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CdaP56389 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CdaP56389 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CdaP56389 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CdaP56389 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CdaP56389 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CdaP56389 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CdaP56389 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CdaP56389 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CdaP56389 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CdaP56389 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CdaP56389 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CdaP56389 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CdaP56389 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CdaP56389 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CdaP56389 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CdaP56389 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CdaP56389 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CdaP56389 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CdaP56389 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CdaP56389 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CdaP56389 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CdaP56389 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CdaP56389 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CdaP56389 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CdaP56389 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CdaP56389 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CdaP56389 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CdaP56389 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CdaP56389 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CdaP56389 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CdaP56389 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CdaP56389 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CdaP56389 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CdaP56389 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CdaP56389 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CdaP56389 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CdaP56389 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CdaP56389 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CdaP56389 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CdaP56389 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CdaP56389 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CdaP56389 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CdaP56389 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CdaP56389 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CdaP56389 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CdaP56389 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CdaP56389 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CdaP56389 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CdaP56389 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CdaP56389 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CdaP56389 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CdaP56389 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CdaP56389 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CdaP56389 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CdaP56389 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CdaP56389 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CdaP56389 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CdaP56389 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CdaP56389 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CdaP56389 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CdaP56389 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CdaP56389 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CdaP56389 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CdaP56389 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CdaP56389 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CdaP56389 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CdaP56389 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CdaP56389 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CdaP56389 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CdaP56389 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CdaP56389 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CdaP56389 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CdaP56389 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CdaP56389 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CdaP56389 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CdaP56389 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CdaP56389 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms