Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5eP56382 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5eP56382 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5eP56382 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms