Protein–RNA interactions for Protein: P55012

Slc12a2, Solute carrier family 12 member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a2P55012 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc12a2P55012 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a2P55012 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc12a2P55012 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc12a2P55012 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a2P55012 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms