Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn5P54830 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn5P54830 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn5P54830 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn5P54830 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn5P54830 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms