Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmc4P54775 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmc4P54775 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psmc4P54775 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psmc4P54775 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Psmc4P54775 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Psmc4P54775 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psmc4P54775 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psmc4P54775 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psmc4P54775 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psmc4P54775 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psmc4P54775 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psmc4P54775 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psmc4P54775 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psmc4P54775 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms