Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pms2P54279 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pms2P54279 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pms2P54279 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pms2P54279 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pms2P54279 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pms2P54279 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pms2P54279 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pms2P54279 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pms2P54279 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pms2P54279 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pms2P54279 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pms2P54279 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pms2P54279 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pms2P54279 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pms2P54279 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pms2P54279 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pms2P54279 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pms2P54279 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 833 ms