Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PitpnbP53811 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PitpnbP53811 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PitpnbP53811 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PitpnbP53811 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PitpnbP53811 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms