Protein–RNA interactions for Protein: P51945

Ccng1, Cyclin-G1, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccng1P51945 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccng1P51945 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccng1P51945 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccng1P51945 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccng1P51945 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccng1P51945 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccng1P51945 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccng1P51945 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccng1P51945 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccng1P51945 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccng1P51945 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccng1P51945 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccng1P51945 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 390 ms