Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn1P51942 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Matn1P51942 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn1P51942 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn1P51942 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Matn1P51942 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn1P51942 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Matn1P51942 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn1P51942 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Matn1P51942 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn1P51942 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn1P51942 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Matn1P51942 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matn1P51942 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matn1P51942 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn1P51942 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn1P51942 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn1P51942 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn1P51942 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn1P51942 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms