Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SftpdP50404 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SftpdP50404 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SftpdP50404 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SftpdP50404 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SftpdP50404 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SftpdP50404 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SftpdP50404 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SftpdP50404 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SftpdP50404 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SftpdP50404 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SftpdP50404 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SftpdP50404 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SftpdP50404 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SftpdP50404 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SftpdP50404 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SftpdP50404 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SftpdP50404 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SftpdP50404 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SftpdP50404 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SftpdP50404 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SftpdP50404 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SftpdP50404 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms