Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpreP49446 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpreP49446 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpreP49446 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpreP49446 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpreP49446 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpreP49446 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpreP49446 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PtpreP49446 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpreP49446 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpreP49446 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtpreP49446 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms