Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
PcntP48725 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
PcntP48725 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
PcntP48725 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
PcntP48725 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
PcntP48725 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
PcntP48725 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
PcntP48725 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25,39■■□□□ 1,66
PcntP48725 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
PcntP48725 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
PcntP48725 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
PcntP48725 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
PcntP48725 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
PcntP48725 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
PcntP48725 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
PcntP48725 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
PcntP48725 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
PcntP48725 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
PcntP48725 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25,35■■□□□ 1,65
PcntP48725 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
PcntP48725 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
PcntP48725 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
PcntP48725 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
PcntP48725 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
PcntP48725 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25,33■■□□□ 1,64
PcntP48725 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,64
PcntP48725 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
PcntP48725 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
PcntP48725 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
PcntP48725 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
PcntP48725 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
PcntP48725 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
PcntP48725 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
PcntP48725 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
PcntP48725 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
PcntP48725 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
PcntP48725 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
PcntP48725 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
PcntP48725 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
PcntP48725 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
PcntP48725 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
PcntP48725 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
PcntP48725 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
PcntP48725 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
PcntP48725 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
PcntP48725 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
PcntP48725 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
PcntP48725 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
PcntP48725 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
PcntP48725 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
PcntP48725 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
PcntP48725 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
PcntP48725 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
PcntP48725 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
PcntP48725 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
PcntP48725 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,25■■□□□ 1,63
PcntP48725 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
PcntP48725 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
PcntP48725 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
PcntP48725 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
PcntP48725 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
PcntP48725 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
PcntP48725 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
PcntP48725 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
PcntP48725 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
PcntP48725 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
PcntP48725 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
PcntP48725 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
PcntP48725 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
PcntP48725 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
PcntP48725 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
PcntP48725 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
PcntP48725 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
PcntP48725 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
PcntP48725 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
PcntP48725 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,17■■□□□ 1,62
PcntP48725 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
PcntP48725 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
PcntP48725 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25,16■■□□□ 1,62
PcntP48725 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
PcntP48725 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
PcntP48725 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
PcntP48725 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
PcntP48725 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25,15■■□□□ 1,62
PcntP48725 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
PcntP48725 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
PcntP48725 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25,14■■□□□ 1,61
PcntP48725 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25,14■■□□□ 1,61
PcntP48725 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
PcntP48725 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
PcntP48725 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
PcntP48725 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
PcntP48725 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
PcntP48725 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
PcntP48725 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
PcntP48725 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
PcntP48725 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
PcntP48725 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
PcntP48725 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
PcntP48725 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,4 ms