Protein–RNA interactions for Protein: P48453

Ppp3cb, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp3cbP48453 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp3cbP48453 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp3cbP48453 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp3cbP48453 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp3cbP48453 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp3cbP48453 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp3cbP48453 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp3cbP48453 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp3cbP48453 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp3cbP48453 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp3cbP48453 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp3cbP48453 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3cbP48453 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp3cbP48453 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp3cbP48453 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3cbP48453 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3cbP48453 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3cbP48453 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3cbP48453 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp3cbP48453 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms