Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpiaP47968 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RpiaP47968 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpiaP47968 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpiaP47968 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpiaP47968 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpiaP47968 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpiaP47968 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpiaP47968 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpiaP47968 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpiaP47968 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpiaP47968 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpiaP47968 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpiaP47968 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpiaP47968 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RpiaP47968 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpiaP47968 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms