Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpiaP47968 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RpiaP47968 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpiaP47968 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpiaP47968 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpiaP47968 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpiaP47968 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpiaP47968 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpiaP47968 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpiaP47968 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpiaP47968 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpiaP47968 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpiaP47968 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpiaP47968 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpiaP47968 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpiaP47968 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpiaP47968 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpiaP47968 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpiaP47968 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpiaP47968 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RpiaP47968 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpiaP47968 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 639.3 ms