Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Igfbp3P47878 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igfbp3P47878 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igfbp3P47878 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Igfbp3P47878 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igfbp3P47878 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igfbp3P47878 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igfbp3P47878 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igfbp3P47878 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igfbp3P47878 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms