Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf4P47741 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnfrsf4P47741 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf4P47741 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf4P47741 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf4P47741 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf4P47741 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms