Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax7P47239 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax7P47239 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax7P47239 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax7P47239 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pax7P47239 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pax7P47239 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pax7P47239 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pax7P47239 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pax7P47239 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pax7P47239 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax7P47239 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pax7P47239 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms