Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zic1P46684 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zic1P46684 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zic1P46684 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zic1P46684 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zic1P46684 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zic1P46684 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zic1P46684 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zic1P46684 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zic1P46684 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zic1P46684 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zic1P46684 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zic1P46684 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zic1P46684 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zic1P46684 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zic1P46684 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zic1P46684 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zic1P46684 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Zic1P46684 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zic1P46684 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zic1P46684 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zic1P46684 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms