Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn1bP46414 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkn1bP46414 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn1bP46414 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkn1bP46414 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn1bP46414 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn1bP46414 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn1bP46414 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn1bP46414 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn1bP46414 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn1bP46414 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkn1bP46414 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkn1bP46414 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdkn1bP46414 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdkn1bP46414 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms