Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtgfrP43117 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtgfrP43117 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PtgfrP43117 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtgfrP43117 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms