Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NodalP43021 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NodalP43021 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NodalP43021 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NodalP43021 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NodalP43021 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NodalP43021 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NodalP43021 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NodalP43021 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NodalP43021 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NodalP43021 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NodalP43021 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NodalP43021 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NodalP43021 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NodalP43021 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NodalP43021 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NodalP43021 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NodalP43021 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NodalP43021 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NodalP43021 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NodalP43021 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NodalP43021 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NodalP43021 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NodalP43021 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NodalP43021 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NodalP43021 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NodalP43021 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NodalP43021 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NodalP43021 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NodalP43021 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NodalP43021 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NodalP43021 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NodalP43021 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NodalP43021 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NodalP43021 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NodalP43021 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NodalP43021 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NodalP43021 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NodalP43021 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NodalP43021 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NodalP43021 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NodalP43021 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NodalP43021 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NodalP43021 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NodalP43021 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NodalP43021 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NodalP43021 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NodalP43021 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NodalP43021 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NodalP43021 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NodalP43021 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NodalP43021 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NodalP43021 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NodalP43021 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NodalP43021 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NodalP43021 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NodalP43021 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NodalP43021 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NodalP43021 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NodalP43021 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NodalP43021 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NodalP43021 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NodalP43021 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NodalP43021 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NodalP43021 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NodalP43021 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NodalP43021 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NodalP43021 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NodalP43021 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NodalP43021 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NodalP43021 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NodalP43021 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NodalP43021 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NodalP43021 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NodalP43021 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NodalP43021 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NodalP43021 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NodalP43021 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NodalP43021 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NodalP43021 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NodalP43021 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NodalP43021 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NodalP43021 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NodalP43021 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms