Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pik3caP42337 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3caP42337 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pik3caP42337 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pik3caP42337 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3caP42337 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3caP42337 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3caP42337 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3caP42337 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3caP42337 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pik3caP42337 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pik3caP42337 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pik3caP42337 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pik3caP42337 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pik3caP42337 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms