Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv1P41164 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Etv1P41164 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Etv1P41164 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv1P41164 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv1P41164 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Etv1P41164 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv1P41164 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv1P41164 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Etv1P41164 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv1P41164 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv1P41164 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms