Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VhlP40338 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VhlP40338 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VhlP40338 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VhlP40338 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VhlP40338 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VhlP40338 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VhlP40338 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VhlP40338 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VhlP40338 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VhlP40338 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VhlP40338 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VhlP40338 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VhlP40338 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VhlP40338 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VhlP40338 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VhlP40338 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VhlP40338 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VhlP40338 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VhlP40338 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VhlP40338 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VhlP40338 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VhlP40338 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VhlP40338 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VhlP40338 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VhlP40338 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VhlP40338 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VhlP40338 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VhlP40338 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VhlP40338 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VhlP40338 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VhlP40338 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VhlP40338 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VhlP40338 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VhlP40338 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VhlP40338 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VhlP40338 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VhlP40338 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VhlP40338 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VhlP40338 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VhlP40338 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VhlP40338 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VhlP40338 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VhlP40338 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VhlP40338 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VhlP40338 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VhlP40338 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VhlP40338 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VhlP40338 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VhlP40338 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VhlP40338 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VhlP40338 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VhlP40338 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VhlP40338 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VhlP40338 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VhlP40338 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VhlP40338 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VhlP40338 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VhlP40338 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VhlP40338 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VhlP40338 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VhlP40338 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VhlP40338 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VhlP40338 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VhlP40338 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VhlP40338 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VhlP40338 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VhlP40338 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VhlP40338 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VhlP40338 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VhlP40338 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VhlP40338 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VhlP40338 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VhlP40338 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VhlP40338 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VhlP40338 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VhlP40338 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VhlP40338 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VhlP40338 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VhlP40338 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VhlP40338 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VhlP40338 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VhlP40338 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VhlP40338 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VhlP40338 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VhlP40338 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VhlP40338 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VhlP40338 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VhlP40338 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VhlP40338 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VhlP40338 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VhlP40338 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VhlP40338 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VhlP40338 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VhlP40338 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VhlP40338 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VhlP40338 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VhlP40338 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VhlP40338 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VhlP40338 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms