Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fen1P39749 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fen1P39749 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fen1P39749 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fen1P39749 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fen1P39749 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fen1P39749 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fen1P39749 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fen1P39749 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fen1P39749 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Fen1P39749 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fen1P39749 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fen1P39749 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fen1P39749 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.3 ms