Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Traf1P39428 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Traf1P39428 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Traf1P39428 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Traf1P39428 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Traf1P39428 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Traf1P39428 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Traf1P39428 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Traf1P39428 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Traf1P39428 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Traf1P39428 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Traf1P39428 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Traf1P39428 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Traf1P39428 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Traf1P39428 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Traf1P39428 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Traf1P39428 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Traf1P39428 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Traf1P39428 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Traf1P39428 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Traf1P39428 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Traf1P39428 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Traf1P39428 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Traf1P39428 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,92
Traf1P39428 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Traf1P39428 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Traf1P39428 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Traf1P39428 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Traf1P39428 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms