Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin1P35438 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin1P35438 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin1P35438 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin1P35438 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin1P35438 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin1P35438 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin1P35438 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin1P35438 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin1P35438 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin1P35438 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin1P35438 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin1P35438 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin1P35438 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin1P35438 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin1P35438 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin1P35438 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin1P35438 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin1P35438 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin1P35438 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Grin1P35438 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grin1P35438 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin1P35438 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin1P35438 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin1P35438 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Grin1P35438 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms