Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cd22P35329 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cd22P35329 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cd22P35329 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cd22P35329 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd22P35329 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd22P35329 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd22P35329 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd22P35329 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd22P35329 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd22P35329 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Cd22P35329 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd22P35329 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cd22P35329 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd22P35329 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd22P35329 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cd22P35329 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cd22P35329 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cd22P35329 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cd22P35329 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cd22P35329 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cd22P35329 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms