Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab23P35288 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab23P35288 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab23P35288 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab23P35288 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab23P35288 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab23P35288 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab23P35288 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab23P35288 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab23P35288 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab23P35288 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab23P35288 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab23P35288 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab23P35288 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab23P35288 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms