Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoc3P33622 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoc3P33622 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoc3P33622 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms