Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd28P31041 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd28P31041 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd28P31041 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd28P31041 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd28P31041 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd28P31041 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd28P31041 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd28P31041 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd28P31041 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd28P31041 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd28P31041 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd28P31041 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd28P31041 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms