Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk4P30285 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk4P30285 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk4P30285 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk4P30285 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms