Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RxraP28700 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RxraP28700 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RxraP28700 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RxraP28700 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RxraP28700 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RxraP28700 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RxraP28700 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RxraP28700 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RxraP28700 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RxraP28700 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RxraP28700 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RxraP28700 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RxraP28700 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RxraP28700 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RxraP28700 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RxraP28700 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RxraP28700 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RxraP28700 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RxraP28700 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RxraP28700 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RxraP28700 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RxraP28700 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RxraP28700 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RxraP28700 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RxraP28700 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RxraP28700 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RxraP28700 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RxraP28700 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RxraP28700 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RxraP28700 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RxraP28700 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RxraP28700 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RxraP28700 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RxraP28700 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RxraP28700 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RxraP28700 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RxraP28700 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RxraP28700 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RxraP28700 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RxraP28700 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RxraP28700 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RxraP28700 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RxraP28700 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RxraP28700 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RxraP28700 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RxraP28700 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RxraP28700 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RxraP28700 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RxraP28700 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RxraP28700 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RxraP28700 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RxraP28700 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RxraP28700 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RxraP28700 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RxraP28700 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RxraP28700 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RxraP28700 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RxraP28700 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RxraP28700 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RxraP28700 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RxraP28700 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RxraP28700 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RxraP28700 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RxraP28700 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RxraP28700 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RxraP28700 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RxraP28700 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RxraP28700 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RxraP28700 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RxraP28700 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RxraP28700 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxraP28700 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxraP28700 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxraP28700 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxraP28700 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RxraP28700 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RxraP28700 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RxraP28700 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RxraP28700 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RxraP28700 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RxraP28700 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RxraP28700 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RxraP28700 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RxraP28700 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RxraP28700 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RxraP28700 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RxraP28700 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RxraP28700 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RxraP28700 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RxraP28700 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RxraP28700 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxraP28700 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxraP28700 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxraP28700 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxraP28700 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxraP28700 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxraP28700 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxraP28700 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RxraP28700 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms