Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Etv4P28322 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Etv4P28322 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Etv4P28322 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Etv4P28322 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Etv4P28322 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Etv4P28322 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Etv4P28322 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Etv4P28322 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Etv4P28322 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Etv4P28322 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Etv4P28322 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Etv4P28322 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Etv4P28322 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Etv4P28322 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Etv4P28322 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Etv4P28322 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Etv4P28322 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Etv4P28322 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms