Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde6aP27664 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde6aP27664 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pde6aP27664 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pde6aP27664 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pde6aP27664 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde6aP27664 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde6aP27664 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde6aP27664 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pde6aP27664 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde6aP27664 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pde6aP27664 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Pde6aP27664 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pde6aP27664 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pde6aP27664 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde6aP27664 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde6aP27664 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6aP27664 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pde6aP27664 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms