Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfkb1P25799 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nfkb1P25799 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfkb1P25799 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfkb1P25799 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfkb1P25799 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfkb1P25799 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms