Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZfaP23607 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZfaP23607 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZfaP23607 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZfaP23607 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZfaP23607 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZfaP23607 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZfaP23607 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZfaP23607 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZfaP23607 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZfaP23607 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZfaP23607 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZfaP23607 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZfaP23607 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZfaP23607 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZfaP23607 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZfaP23607 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZfaP23607 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZfaP23607 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms