Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KitlgP20826 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KitlgP20826 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KitlgP20826 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KitlgP20826 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KitlgP20826 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KitlgP20826 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KitlgP20826 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KitlgP20826 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KitlgP20826 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KitlgP20826 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KitlgP20826 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KitlgP20826 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KitlgP20826 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KitlgP20826 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KitlgP20826 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KitlgP20826 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KitlgP20826 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KitlgP20826 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KitlgP20826 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KitlgP20826 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KitlgP20826 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms