Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChrneP20782 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChrneP20782 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChrneP20782 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChrneP20782 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChrneP20782 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrneP20782 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChrneP20782 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChrneP20782 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChrneP20782 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChrneP20782 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrneP20782 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrneP20782 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ChrneP20782 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChrneP20782 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChrneP20782 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrneP20782 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrneP20782 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrneP20782 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrneP20782 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ChrneP20782 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChrneP20782 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChrneP20782 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChrneP20782 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChrneP20782 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChrneP20782 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChrneP20782 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChrneP20782 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChrneP20782 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms