Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SagP20443 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SagP20443 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SagP20443 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SagP20443 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SagP20443 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SagP20443 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SagP20443 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SagP20443 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SagP20443 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SagP20443 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SagP20443 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SagP20443 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SagP20443 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SagP20443 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SagP20443 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SagP20443 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SagP20443 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SagP20443 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SagP20443 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SagP20443 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SagP20443 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SagP20443 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SagP20443 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SagP20443 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SagP20443 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SagP20443 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SagP20443 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SagP20443 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SagP20443 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SagP20443 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SagP20443 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SagP20443 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SagP20443 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SagP20443 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SagP20443 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SagP20443 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SagP20443 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SagP20443 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SagP20443 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SagP20443 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SagP20443 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SagP20443 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SagP20443 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SagP20443 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SagP20443 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SagP20443 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SagP20443 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SagP20443 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SagP20443 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SagP20443 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SagP20443 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SagP20443 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SagP20443 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SagP20443 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SagP20443 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SagP20443 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SagP20443 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SagP20443 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SagP20443 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SagP20443 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SagP20443 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SagP20443 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SagP20443 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SagP20443 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SagP20443 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SagP20443 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SagP20443 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SagP20443 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SagP20443 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SagP20443 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SagP20443 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SagP20443 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SagP20443 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SagP20443 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SagP20443 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SagP20443 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SagP20443 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SagP20443 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SagP20443 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SagP20443 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SagP20443 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SagP20443 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SagP20443 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SagP20443 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SagP20443 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SagP20443 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SagP20443 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SagP20443 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SagP20443 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SagP20443 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SagP20443 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms