Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrphP15331 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrphP15331 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrphP15331 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrphP15331 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrphP15331 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrphP15331 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrphP15331 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrphP15331 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrphP15331 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrphP15331 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrphP15331 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PrphP15331 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrphP15331 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrphP15331 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PrphP15331 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrphP15331 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrphP15331 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrphP15331 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrphP15331 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrphP15331 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrphP15331 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrphP15331 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrphP15331 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrphP15331 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrphP15331 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrphP15331 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrphP15331 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrphP15331 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrphP15331 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrphP15331 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrphP15331 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrphP15331 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrphP15331 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrphP15331 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrphP15331 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrphP15331 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PrphP15331 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrphP15331 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrphP15331 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrphP15331 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrphP15331 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrphP15331 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrphP15331 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrphP15331 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrphP15331 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrphP15331 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrphP15331 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrphP15331 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrphP15331 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrphP15331 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrphP15331 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrphP15331 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrphP15331 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrphP15331 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrphP15331 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrphP15331 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrphP15331 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrphP15331 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrphP15331 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrphP15331 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrphP15331 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrphP15331 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrphP15331 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PrphP15331 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrphP15331 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrphP15331 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrphP15331 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrphP15331 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrphP15331 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrphP15331 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrphP15331 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrphP15331 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrphP15331 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrphP15331 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrphP15331 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrphP15331 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrphP15331 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrphP15331 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PrphP15331 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrphP15331 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrphP15331 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrphP15331 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrphP15331 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrphP15331 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrphP15331 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PrphP15331 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrphP15331 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrphP15331 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrphP15331 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrphP15331 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrphP15331 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrphP15331 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrphP15331 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrphP15331 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrphP15331 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrphP15331 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrphP15331 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrphP15331 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrphP15331 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms