Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23,89■■□□□ 1,42
DmdP11531 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
DmdP11531 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
DmdP11531 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
DmdP11531 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23,87■■□□□ 1,41
DmdP11531 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
DmdP11531 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
DmdP11531 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23,86■■□□□ 1,41
DmdP11531 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23,86■■□□□ 1,41
DmdP11531 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
DmdP11531 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
DmdP11531 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
DmdP11531 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
DmdP11531 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
DmdP11531 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
DmdP11531 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23,84■■□□□ 1,41
DmdP11531 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23,83■■□□□ 1,41
DmdP11531 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
DmdP11531 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
DmdP11531 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
DmdP11531 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
DmdP11531 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
DmdP11531 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
DmdP11531 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
DmdP11531 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
DmdP11531 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
DmdP11531 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
DmdP11531 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
DmdP11531 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
DmdP11531 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
DmdP11531 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
DmdP11531 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
DmdP11531 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
DmdP11531 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
DmdP11531 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
DmdP11531 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
DmdP11531 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
DmdP11531 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
DmdP11531 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,75■■□□□ 1,39
DmdP11531 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
DmdP11531 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
DmdP11531 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
DmdP11531 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23,73■■□□□ 1,39
DmdP11531 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
DmdP11531 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
DmdP11531 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
DmdP11531 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
DmdP11531 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,7■■□□□ 1,38
DmdP11531 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23,7■■□□□ 1,38
DmdP11531 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
DmdP11531 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
DmdP11531 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
DmdP11531 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
DmdP11531 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
DmdP11531 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23,69■■□□□ 1,38
DmdP11531 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
DmdP11531 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
DmdP11531 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
DmdP11531 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
DmdP11531 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
DmdP11531 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
DmdP11531 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
DmdP11531 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
DmdP11531 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
DmdP11531 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
DmdP11531 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
DmdP11531 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
DmdP11531 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
DmdP11531 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,64■■□□□ 1,38
DmdP11531 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
DmdP11531 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
DmdP11531 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
DmdP11531 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
DmdP11531 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
DmdP11531 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
DmdP11531 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
DmdP11531 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
DmdP11531 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
DmdP11531 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
DmdP11531 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
DmdP11531 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
DmdP11531 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
DmdP11531 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
DmdP11531 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
DmdP11531 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
DmdP11531 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
DmdP11531 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
DmdP11531 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23,58■■□□□ 1,37
DmdP11531 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
DmdP11531 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,58■■□□□ 1,37
DmdP11531 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
DmdP11531 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23,58■■□□□ 1,36
DmdP11531 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
DmdP11531 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
DmdP11531 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
DmdP11531 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23,56■■□□□ 1,36
DmdP11531 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
DmdP11531 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
DmdP11531 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
DmdP11531 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms