Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DmdP11531 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DmdP11531 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DmdP11531 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DmdP11531 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DmdP11531 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DmdP11531 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DmdP11531 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DmdP11531 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DmdP11531 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DmdP11531 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DmdP11531 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DmdP11531 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DmdP11531 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DmdP11531 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DmdP11531 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DmdP11531 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DmdP11531 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DmdP11531 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DmdP11531 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DmdP11531 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DmdP11531 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DmdP11531 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DmdP11531 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DmdP11531 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DmdP11531 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DmdP11531 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DmdP11531 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DmdP11531 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DmdP11531 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DmdP11531 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DmdP11531 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DmdP11531 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DmdP11531 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DmdP11531 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DmdP11531 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DmdP11531 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DmdP11531 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DmdP11531 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DmdP11531 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DmdP11531 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DmdP11531 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DmdP11531 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DmdP11531 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DmdP11531 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DmdP11531 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DmdP11531 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DmdP11531 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DmdP11531 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DmdP11531 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DmdP11531 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DmdP11531 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DmdP11531 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DmdP11531 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DmdP11531 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DmdP11531 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DmdP11531 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DmdP11531 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DmdP11531 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DmdP11531 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DmdP11531 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DmdP11531 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DmdP11531 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DmdP11531 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DmdP11531 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DmdP11531 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DmdP11531 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DmdP11531 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DmdP11531 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DmdP11531 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DmdP11531 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DmdP11531 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DmdP11531 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DmdP11531 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DmdP11531 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DmdP11531 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DmdP11531 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DmdP11531 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DmdP11531 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DmdP11531 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DmdP11531 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DmdP11531 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DmdP11531 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DmdP11531 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DmdP11531 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DmdP11531 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DmdP11531 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DmdP11531 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DmdP11531 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DmdP11531 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DmdP11531 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DmdP11531 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DmdP11531 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DmdP11531 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DmdP11531 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DmdP11531 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DmdP11531 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DmdP11531 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DmdP11531 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DmdP11531 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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