Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RaraP11416 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RaraP11416 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RaraP11416 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RaraP11416 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RaraP11416 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RaraP11416 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RaraP11416 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RaraP11416 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RaraP11416 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RaraP11416 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RaraP11416 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RaraP11416 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RaraP11416 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RaraP11416 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RaraP11416 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RaraP11416 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RaraP11416 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RaraP11416 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RaraP11416 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RaraP11416 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RaraP11416 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RaraP11416 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RaraP11416 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RaraP11416 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RaraP11416 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RaraP11416 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RaraP11416 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RaraP11416 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RaraP11416 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RaraP11416 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RaraP11416 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RaraP11416 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RaraP11416 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RaraP11416 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RaraP11416 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RaraP11416 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RaraP11416 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RaraP11416 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RaraP11416 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RaraP11416 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RaraP11416 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RaraP11416 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RaraP11416 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RaraP11416 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RaraP11416 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RaraP11416 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RaraP11416 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RaraP11416 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RaraP11416 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RaraP11416 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RaraP11416 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RaraP11416 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RaraP11416 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RaraP11416 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RaraP11416 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RaraP11416 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RaraP11416 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RaraP11416 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RaraP11416 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RaraP11416 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RaraP11416 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RaraP11416 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RaraP11416 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RaraP11416 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RaraP11416 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RaraP11416 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RaraP11416 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RaraP11416 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RaraP11416 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RaraP11416 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RaraP11416 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RaraP11416 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RaraP11416 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RaraP11416 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RaraP11416 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RaraP11416 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RaraP11416 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RaraP11416 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RaraP11416 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RaraP11416 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RaraP11416 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RaraP11416 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RaraP11416 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RaraP11416 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RaraP11416 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RaraP11416 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RaraP11416 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RaraP11416 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RaraP11416 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RaraP11416 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RaraP11416 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RaraP11416 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RaraP11416 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RaraP11416 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RaraP11416 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RaraP11416 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RaraP11416 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RaraP11416 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RaraP11416 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms