Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PolP11369 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolP11369 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolP11369 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolP11369 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolP11369 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolP11369 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolP11369 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolP11369 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PolP11369 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolP11369 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolP11369 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolP11369 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolP11369 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PolP11369 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolP11369 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolP11369 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolP11369 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PolP11369 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PolP11369 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PolP11369 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PolP11369 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PolP11369 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PolP11369 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PolP11369 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PolP11369 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PolP11369 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PolP11369 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PolP11369 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PolP11369 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolP11369 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolP11369 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolP11369 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolP11369 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolP11369 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolP11369 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolP11369 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolP11369 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolP11369 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PolP11369 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolP11369 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolP11369 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PolP11369 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PolP11369 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolP11369 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolP11369 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolP11369 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolP11369 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolP11369 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolP11369 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolP11369 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolP11369 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolP11369 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolP11369 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolP11369 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PolP11369 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PolP11369 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolP11369 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolP11369 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolP11369 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolP11369 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolP11369 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolP11369 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolP11369 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolP11369 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolP11369 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolP11369 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolP11369 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolP11369 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolP11369 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PolP11369 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolP11369 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolP11369 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PolP11369 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolP11369 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolP11369 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolP11369 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolP11369 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolP11369 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolP11369 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolP11369 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolP11369 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolP11369 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PolP11369 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PolP11369 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PolP11369 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PolP11369 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PolP11369 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PolP11369 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolP11369 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolP11369 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolP11369 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PolP11369 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PolP11369 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PolP11369 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PolP11369 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PolP11369 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolP11369 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PolP11369 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolP11369 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms