Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prf1P10820 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prf1P10820 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prf1P10820 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prf1P10820 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prf1P10820 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prf1P10820 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prf1P10820 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prf1P10820 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prf1P10820 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prf1P10820 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prf1P10820 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prf1P10820 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prf1P10820 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prf1P10820 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prf1P10820 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prf1P10820 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prf1P10820 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prf1P10820 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prf1P10820 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prf1P10820 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prf1P10820 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prf1P10820 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prf1P10820 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prf1P10820 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prf1P10820 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prf1P10820 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prf1P10820 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prf1P10820 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prf1P10820 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prf1P10820 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prf1P10820 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prf1P10820 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prf1P10820 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prf1P10820 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prf1P10820 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prf1P10820 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prf1P10820 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prf1P10820 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prf1P10820 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms