Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NefmP08553 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NefmP08553 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NefmP08553 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NefmP08553 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NefmP08553 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NefmP08553 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NefmP08553 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NefmP08553 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NefmP08553 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NefmP08553 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NefmP08553 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NefmP08553 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NefmP08553 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NefmP08553 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NefmP08553 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NefmP08553 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NefmP08553 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NefmP08553 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NefmP08553 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NefmP08553 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NefmP08553 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NefmP08553 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NefmP08553 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NefmP08553 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NefmP08553 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NefmP08553 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NefmP08553 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NefmP08553 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NefmP08553 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NefmP08553 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NefmP08553 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NefmP08553 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NefmP08553 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NefmP08553 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NefmP08553 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NefmP08553 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NefmP08553 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NefmP08553 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NefmP08553 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NefmP08553 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NefmP08553 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NefmP08553 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NefmP08553 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NefmP08553 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NefmP08553 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NefmP08553 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NefmP08553 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NefmP08553 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NefmP08553 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NefmP08553 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NefmP08553 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NefmP08553 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NefmP08553 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NefmP08553 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NefmP08553 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NefmP08553 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NefmP08553 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
NefmP08553 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NefmP08553 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NefmP08553 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NefmP08553 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NefmP08553 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NefmP08553 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NefmP08553 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NefmP08553 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NefmP08553 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NefmP08553 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NefmP08553 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NefmP08553 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NefmP08553 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
NefmP08553 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
NefmP08553 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NefmP08553 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NefmP08553 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
NefmP08553 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NefmP08553 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NefmP08553 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NefmP08553 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NefmP08553 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NefmP08553 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NefmP08553 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NefmP08553 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NefmP08553 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NefmP08553 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NefmP08553 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
NefmP08553 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
NefmP08553 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NefmP08553 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NefmP08553 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NefmP08553 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NefmP08553 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NefmP08553 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NefmP08553 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NefmP08553 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NefmP08553 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NefmP08553 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NefmP08553 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NefmP08553 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NefmP08553 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms