Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt4P07744 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt4P07744 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt4P07744 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt4P07744 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt4P07744 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt4P07744 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt4P07744 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt4P07744 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt4P07744 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt4P07744 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt4P07744 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt4P07744 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt4P07744 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt4P07744 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt4P07744 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt4P07744 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt4P07744 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt4P07744 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms